柔嫩艾美耳球蟲主要侵害蛋雞盲腸，會導(dǎo)致盲腸當(dāng)中有凝血或者有出血塊，會導(dǎo)致蛋雞拉血便的狀況，死亡率較高。

布氏艾美耳球蟲寄生于小腸的后段，整個腸黏膜呈“干酪樣病變斑”形成“偽膜”，腸黏膜增厚和水腫，可以引起嚴(yán)重的腸炎，死亡率較高。

毒害艾美耳球蟲主要侵害小腸中段也可以引起嚴(yán)重腸炎，或者引起小腸充血，死亡率較高。

巨型艾美耳球蟲，會造成小腸中段有淤血或者有紫色血斑點(diǎn)。

堆形艾美耳球蟲主要侵害小腸的前段部分，一般在十二指腸，前段黏膜上有白色小點(diǎn)或是白帶一樣一些癥狀。